蛋白质分析仪分为蛋白水解分析系统（钠盐系统）和游离氨基酸分析系统（锂盐系统），利用不同浓度和pH值的柠檬酸钠或柠檬酸锂进行梯度洗脱。其中钠盐系统一次zui多分析约25种氨基酸，速度较快，基线平直度好；锂盐系统一次zui多分析约50种氨基酸，速度较慢，基线一般不如钠盐系统好。采用该套检验流程，能尽早筛选出低蛋白奶粉，检测质量，既满足了快速检测的需要，又能检验结果的性，特别适合于特殊时期快速、大批量检测奶粉中蛋白质含量。
这些产物对一定波长可见光会产生有选择性吸收，颜色的深浅即吸光度的高低与样品中特征氨基酸的浓度成相关性。因此检测的吸光度值经
蛋白质分析仪内置的标准曲线软件，结合该特征氨基酸占蛋白质比例自动计算，得出样品中蛋白质的浓度。蛋白质是生命的物质基础，是构成细胞的基本有机物。没有蛋白质就没有生命。因此，它是与生命及与各种形式的生命活动紧密在一起的物质。蛋白质，尤其是动物性蛋白摄入过多，对人体同样有害。过多的动物蛋白摄入，同时造成含硫氨基酸摄入过多，这样可加速骨骼中钙质的丢失，易产生骨质疏松。利用蛋白质测定仪的过程中，还须注意所有试剂均用不含氨的蒸馏水配制。蒸汽发生瓶中水呈酸性，以防在碱性时水中游离氨被蒸出而使结果偏高，蛋白质测定仪测定蛋白质，其结果受多方面因素的影响，为使测定结果，在测定时应引起高度重视。
